是否需要设置空气净化
从原理上看，负压隔离病房的污染源是在房间内部，设置负压隔离病房的根本目的是阻止内部的污染物泄露到外界，其防范重点是对排风的过滤处理。目前也没有数据表明空气净化能够有助于呼吸道患者的康复。因此可以认为负压隔离病房并不需要设层流空气净化措施。
从系统运行维护的角度看，进风端设置层流净化可以减少外界的污染物颗粒进入室内，负压隔离病房气流，在一定程度上降低了排风段的HEPA滤纸过滤压力，延长了滤纸的寿命。但一方面层流净化设备的运行成本较高，另一方面繁复的系统也增加了控制逻辑电路和机械安装时出问题的风险。所以除非是收治的患者的过程中有特殊需求，一般不建议在负压隔离病房设置层流净化系统。
房间密闭性属于锦上添花
虽然房间的维护结构缝隙、门窗缝隙如不进行特殊处理是无法完全阻止气体交换，但如前文所说的，维持3Pa以上的静压差就可以在缝隙处形成定向气流而基本杜绝污染物的外泄。因此负压隔离病房并不需要做到像高等级生物安全实验室那样的严格气密性，经济上也不允许。
当然，实践中并不反对在诸如装饰墙板缝隙等位置采用打胶的方式进行加强密封，但这仅属于锦上添花的事情。选用专用气密门窗的性价比并不高。负压隔离病房的运行维护重点还是要保持房间内压力稳定，负压隔离病房，避免因为送排风量控制失误导致的压力倒转。以及对排风过滤的监测。
负压隔离病房在停止运行或转换病种运行时需要进行消毒，这种消毒主要是通过喷洒消毒剂或消毒气体熏蒸的方式实现的，高密负压隔离病房，消毒范围包括室内表面及风管内部。因此在装饰材料的选择上，应主要考虑防水、耐腐蚀的特性，减少缝隙的要求是为了减少藏污纳垢的可能性。
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